Quand on est orphelin et un monstre sommeille en vous alors que vous ne le savez pas, la vie peut etre difficile quand tout le monde vous déteste, c'est en gros la vie de Naruto. En fait, pour ne pas inquiéter les futures générations, les adultes ont caché à leurs enfants la vérité sur Naruto mais ils ont fait hérité leurs haines et leurs méfiances, Naruto était seul tout au long de sa vie, sans famille et sans ami. Pour attirer l'attention de ses camarades de l'Académie, il fait le gaffeur et le farceur mais finalement rien n'y fait. Il a comme tuteur le prof de l'Académie, le professeur Iruka qui enseigne à ses élèves les rudiments des arts ninja. Au bout d'un an, les élève doivent faire un diplôme d'aptitude pour passer aspirant ninja et faire des missions en équipes de trois.

Naruto a essayé trois cet examen avant de parvenir à l'avoir, enfin façon de parler. L'un des juges dit à Naruto que chez le 3e Hokage, il y a un parchemin de technique secrète, si il les apprenait, il sera aspirant ninja. Naruto exécuta et apprit le multi clonage. Seulement, Mizuki, le juge, voulait que Naruto le prenne pour le lui prendre et devenir fort avec les technique inscrite dedans. Iruka résonna Naruto après que Mizuki avoua à Naruto a vérité sur le démon renard, Naruto l'assomma avec sa nouvelle technique, en remerciementpour avour sauver son tuteur Iruka, il devient aspirant.

Plus tard, il rentre dans l'équipe de Sakura Haruno (il est amoureux d'elle) et de Sasuke Ushiwa (ils se détestent) et sous les ordres du puissants mais endormi Kakashi Hatake. Au cours d'une mission, après un combat violant en compagnie de Sasuke contre un jeune garçon ayant des pouvoirs héréditaires, Sasuke fut blessé gravement et Naruto ne supporta pas, il s'énerva et se laissa envahir par Kyubi qui lui donna une puissance incomparable qui terrassa le garçon.

Après être revenu à, ils commencèrent l'examen pour tenter de monter en grade et devenir moyenne classe.Ils y rencontrèrent de terribles adversaires, comme Orochimaru qui semble vouloir Sasuke pour ses pouvoirs cachés ; Garaa du désert de Suna no kuni (pays du sable), qui a un pouvoir terrifiant et d'autres... Ils commencèrent par un test écrit, les aspirants furent stressé par le juge Ibiki Morino, après une hécatombe d'aspirants ayant triché mais repérés, Naruto ne perdit pas son sang froid bien qu'il ne pouvait pas répondre aucun question, il donna du courage à ceux qui restait et les fit passé l'épreuve qui était l'une des épreuves de tricher ou de ne pas se débiner. Puis l'épreuve de survie dans la vallée de la mort, ils combattirent tant bien que mal Orochimaru qui mordit Sasuke et partit, ils réussirent à passer l'épreuve. L'épreuve suivante est un tournoi, il développa une stratégie impressionnante contre Kiba.

Après il fut entraîné par Jiraya, l'un des 3 ninjas de la légende ; il lui apprit comment utiliser Kyubi et à invoquer des crapauds, par le chakkra (énergie) de Kyubi, il invoqua Gama Bunta, le roi des crapauds que seul Jiraya, et Hokage le 4e avait réussit à invoquer.

Puis un autre tournoi eut lieu, Naruto se battit avec Neji et il gagna le match par les étonnement de toute l'assemblée. Mais l'assaut de Konoha eut lieu et dû chercher Sasuke avec Sakura et Shikamaru car il s'est lancé à la poursuite de Garaa en pleine concentration, Sasuke à bout de force laissa Naruto se charger de lui. Un combat impressionnant de l'esprit du sable de Garaa et Gama Bunta et Naruto dans la forêt, Garaa s'enfuit avec son équipe.

Puis il chercha avec Jiraya Tsunade pour qu'elle devienne Hokage, pendant ce temps Jiraya apprit à Naruto l'orbe tourbillonnante. Naruto se battit contre Kabuto qui perdit après que Naruto ait lancé sa technique pour protéger Tsunade à bout de force après son combat avec Kabuto.

Puis de retour à Konoha, il se battit contre Sasuke qui voulait se battre contre lui par la vengeance mais ce combat fut arrêté par Kakashi.

Ensuite il fut envoyé en compagnie de Shikamaru, Chouji, Neji et Kiba pour aller secourir Sasuke. Cette mission se finit par des combat des 5 homme de main de Orochimaru, dont Naruto contre Kimimaro, Sasuke s'enfuit et Naruto se lance à sa poursuite en laissant Lee qui venait de le rejoindre s'occuper de Kimimaro qui s'avérait plus fort que ne pensait Naruto. Naruto parvint à rattraper Sasuke mais un féroce combatles attendait, à la suite de ce combat acharné, Naruto s'évanouit et Sasuke s'enfuit avec des difficulté de déplacement. Kakashi retrouva Naruto et le reconduit à Konoha avc tout les membres de l'équipe qui échouèrent leur mission mais s'en sortit tant bien que mal. Naruto alla s'entrainer avec Jiraya pendant 3ans

Saison 2

A la fin de ces 3ans d'entrainement, Naruto retourne dans son village. Il y retrouva Sakura et les autres qui sont tous devenu moyenne classe, tous sauf lui... Naruto a, durant ces trois ans, grandis par la taille (il dépasse Sakura seulement maintenant) mais aussi mentalement ; il a acquis un nouveau justu qui consiste à matérialiser le chakkra de Kyuubi, ca puissance varie en fonction de la colère de Naruto et du nombre queue qu'il a (ce nombre augmente jusqu'a neuf en fonction de la colère), il de se contre plus à partir de 4 queue et devient un monstre qui dévaste tout sur son passage. Ila aussi acquit le odama rasengan, un super rasengan qu'il peut faire avec une main à une vitesse incroyable. Il prétendit qu'il a changé de vêtement car ses anciens sont parti en poussière et a été obligé de les changer. Au cours d'un combat contre Orochimaru, Naruto se transforma en Kyuubi à 4 queues qui a devasté toute une foret et Orochimau a failli mourrir, il semble que ses membres soit empoisonés...